نظام الخدمة المدنية يحدد عقوبات الموظفين المخالفين وفق نظام الانضباط الوظيفي الصادر بمرسوم ملكي، وتشمل العقوبات: الإنذار، الخصم من الراتب، الحرمان من العلاوة السنوية، تأجيل الترقية، أو الفصل من الخدمة. لا تُوقع العقوبات إلا بعد تحقيق رسمي وضمان حق الدفاع، وتُراعى درجة المخالفة والظروف المحيطة بها.
